·综 述·

环状RNA在心血管疾病临床诊断和预警中的研究进展

吕梦伟1,2, 章 兴3 综述, 张杨杨1,2,4 审校

(1. 南京医科大学上海东方临床医学院,南京 210029; 2. 同济大学心律失常教育部重点实验室,上海 200120; 3. 南京医科大学儿科学院,南京 211166; 4. 同济大学附属东方医院心脏大血管外科,上海 200120)

【摘要】 环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类双链闭合非编码RNA,在心血管疾病发生发展中起着重要的调节作用,它具有相对稳定、特异表达、进化保守等生物学特性,是目前研究的热点之一,在心血管疾病诊断和预警方面具有潜在的应用前景。本文介绍circRNA在多种常见心血管疾病临床诊断和预警的应用现状。

【关键词】 环状RNA; 心血管疾病; 诊断; 预测; 临床价值

人类基因组只有部分DNA用于编码蛋白质,其余大部分转录成各类RNA最终并不被翻译成蛋白质,这些RNA称为非编码RNA[1]。部分非编码RNA参与基因转录后调控、剪切和修饰等,在生命活动中发挥重要的作用。环状RNA(circularRNA,circRNA)是一类双链闭合非编码RNA,无5′帽子结构及3′poly A尾,长度在几百到几千个核苷酸不等,不受RNA外切酶降解,稳定且广泛地存在于真核生物,具有进化保守性[2]。circRNA在许多疾病中起着重要的调控作用,如神经系统疾病、心血管疾病、糖尿病和肿瘤等[3]。本文就circRNA在心血管疾病临床诊断和预警方面的应用研究现状进行综述。

circRNA主要来自于外显子,和一般的RNA剪接模式不同。这种结构上的差异体现在3′端和5′端通过环化的方式结合在一起[4]。目前主要有3种环化的方式。(1) 内含子配对驱动的环化: 以内含子区域的顺式作用元件配对为基础,外显子于前体信使RNA(messenger RNA, mRNA)的侧面相接,形成反义剪接[5]。(2) RNA结合蛋白(RNA bindingprotein, RBP)驱动的环化: RBP识别并且结合内含子中的特定基序,通过RBP之间的二聚作用,外显子两端的剪接位点相互靠近,于前体mRNA的侧边成环[6-7]。(3) 套索驱动式环化: 分为两种,一种是前体mRNA在剪接过程中去除内含子,内含子形成套索结构,此类circRNA不包含外显子;另一种是由于外显子跳读形成套索,此类circRNA包含外显子[8-9]。circRNA广泛表达于人体的各种细胞、外周血、唾液和其他体液中,在某些情况下其表达水平要比相关的线状RNA高10倍以上[5]。circRNA在分裂缓慢的组织细胞中丰度很高(如神经细胞或其他分化程度较高的细胞),在分裂迅速的组织细胞中丰度较低(如癌细胞)[10-11]。由于没有游离端而增加了自身稳定性,且在多种体液中富集,circRNA成为非侵入性生物标志物的理想候选者。

1 circRNA的生物学功能

1.1 微小RNA(microRNA,miRNA)海绵作用

circRNA可以吸附并隔绝miRNA,阻止miRNA与mRNA的相互作用。如来源于CDR1基因的circCDR1AS,含有许多miRNA-7的结合位点,能够抑制miRNA-7对靶基因的调控[12]

1.2 蛋白质支架作用

circRNA可以结合蛋白质,调控其活性。如来源于MBNL1基因的circRNA,包含许多MBNL1的结合位点。当MBNL1蛋白含量过高时,其转录本含量降低,转而生成更多circRNA来结合MBNL1蛋白[6]

1.3 转录调控作用

Hela细胞与H9细胞中有一类circRNA亚型,主要定位于细胞核,通过与小核蛋白颗粒U1相互作用调控RNA聚合酶Ⅱ的活性,提高其亲本基因的转录水平[8,13]

1.4 竞争性抑制作用

由于线状剪接与反义剪接的供体与受体相同,circRNA的产生是以牺牲线状mRNA为代价的。如果蝇S2细胞中提高线状mRNA的含量会导致circRNA的表达水平降低[6]

1.5 蛋白质合成模板

circRNA缺乏典型的5′帽子结构及3′poly A尾,无法被翻译。但序列中引入内部核糖体进入位点可使蛋白质翻译起始不依赖于5′帽子结构,circRNA也可以被翻译成蛋白质[14-16]

2 circRNA与心肌梗死后心力衰竭

左室重构和心功能障碍是急性心肌梗死(acute myocardial infarction, AMI)后常发生的并发症,如何对其准确预测是一个临床难题。Vausort等[17]通过检测心肌梗死相关circRNA(myocardial infarction associatedcircular RNA, MICRA),预测心肌梗死后心力衰竭的发生率。定量反转录聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription-polymerasechain re-action, qRT-PCR)检测结果表明,AMI患者外周血液中的MICRA表达水平显著低于健康志愿者。综合多种变量建立AMI后左室功能衰竭的预测模型,引入MICRA可以改善其预测功能,其综合判别改善指数[18](integrated discrimination improvement, IDI)为0.07。研究发现,左心室射血分数(ejection fraction, EF)≤40%的AMI患者,外周血液中的MICRA水平显著低于EF>40%的AMI患者(P<0.001)[19]。有序回归多变量分析提示,MICRA和AMI后心功能障碍有着密切关系,MICRA能够预测AMI后的心力衰竭。精准医学时代,准确预测患者AMI后心力衰竭的发生风险,可以提前干预,提高治疗效果,有助于医疗资源的合理分配。

3 circRNA与术后心房颤动

心房颤动(atrial fibrillation, AF)是冠状动脉旁路移植术(coronary artery bypass grafting, CABG)后最常见的并发症之一。术后心房颤动(postoperative atrial fibrillation, PoAF)的发生率与发病率、死亡率以及总治疗费用显著相关[20]。为了预防PoAF,临床上常进行药物干预,考虑到药物副作用,对高危患者的干预更有意义。高龄是PoAF公认的危险因素,体质量指数[21]、高血压、糖尿病[22]、左心房增大等也是危险因素,但目前还没有能够被广泛接受的预测PoAF的风险模型。Zhang等[23]应用高通量技术分析患者CABG手术前1周的血样,通过对比PoAF与非PoAF患者的检测结果,发现9种circRNA明显表达差异。扩大样本量(365例)应用qRT-PCR对这9种circRNA进行验证,发现hsa_circ_025016与PoAF强相关性。受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)分析显示,hsa_circ_025016预测PoAF的灵敏度为73.5%,特异度为77.8%,曲线下面积(area under curve, AUC)为0.802,表明 hsa_circ_025016对PoAF有预测效能。Harling等[24]研究表明,外周血液中的miRNA-483-5p表达水平是预测PoAF的潜在生物标志物。与miRNA相比,circRNA由于缺乏游离端而对核糖核酸酶R具有抗性,不容易被降解,其作为PoAF诊断和预后的生物标志物具有更稳定的优势[23]

4 circRNA与冠心病

冠心病(coronary artery disease, CAD)是全球高发病率和高死亡率的心血管疾病,早期诊断CAD的意义重大。目前冠状动脉造影术(coronary arteriography, CAG)是诊断CAD的金标准[25],但这种方法是有创性检查,费用较高,并不适用于低危患者的筛查。心电图(electrocardiogram, ECG)作为无创性的检查,其灵敏度和特异度均比较低,诊断效能不佳。Zhao等[26]通过高通量技术分析CAD患者和健康志愿者的外周血,发现5个差异最大的circRNA。进一步研究表明,其中hsa_circ_0124644的表达水平与CAD的严重程度相关,SYNTAX评分越高,hsa_circ_0124644的含量也越高。ROC曲线分析发现hsa_circ_0124644诊断CAD的灵敏度为0.861,特异度为0.626。引入CAD的相关危险因素,如吸烟、高血压、糖尿病、低密度脂蛋白和总胆固醇,调整后的灵敏度为0.759,特异度为0.704。Li等[27]通过高通量技术研究CAD患者和健康志愿者的外周血,发现2036个差异表达的circRNA,选取其中差异最大的5个circRNA,qRT-PCR发现其中hsa_circ_11806-28、hsa_circ_6510-1和hsa_circ_11783-2的差异有统计学意义,引入相关危险因素后通过Logistic回归分析表明hsa_circ_11783-2与CAD具有相关性。Deng等[28]通过高通量技术比较AMI患者和健康志愿者外周血中的circRNA,发现hsa_circ_081881表达水平差异最大。基因本体论(geneoncology, GO)分析发现hsa_circ_081881有7个miRNA-548位点,可以起到miRNA海绵吸附作用,抑制miRNA-548对血浆中过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptor, PPAR)γ蛋白表达的调控作用,使得PPAR γ表达增加,进而减少泡沫细胞的形成。因此hsa_circ_081881可以作为AMI诊断的潜在生物标志物。

5 circRNA与室间隔缺损

室间隔缺损(ventricular septal defect, VSD)是常见的先天性心脏病,是各种原因导致室间隔在胚胎时期发育不全,形成异常交通,在心室水平产生左向右分流。随着对VSD研究的深入,非编码RNA在心脏发育中起着重要的作用[29]。Liu等[30]收集6例流产胎儿(24~28周),在胎儿期应用超声诊断是否患有VSD,胎儿流产后解剖确认,将其分为VSD组和非VSD组(每组3例)。应用高通量技术,分析两组心肌中circRNA表达的差异,发现6234个差异表达的circRNA。从20个表达差异最大的circRNA中随机选择5个circRNA并通过qRT-PCR进行验证,其差异表达的趋势与高通量技术的结果一致。综合GO分析结果,发现差异circRNA含有许多miRNA-30c结合位点。上调的miRNA-30c被报道可通过相关信号通路影响胚胎发育和P19细胞的分化,影响增殖和凋亡的平衡[31]。circRNA可以作为miRNA-30c的海绵,参与心脏疾病的发生和发展。这些差异表达的circRNA具有筛查诊断VSD的潜在临床应用价值。

6 circRNA与原发性高血压

原发性高血压(essential hypertension, EH)是最常见的一种发病率高、危害性大的心血管疾病。EH的危险因素有很多,目前比较明确的有年龄、性别、区域和社会经济状态[32-33],遗传因素也是目前研究的热点。Bao等[34]根据CircBase数据库的生物信息学分析,提示hsa_circ_0037911和EH的发生、发展高度相关。通过检测EH患者和健康志愿者外周血,证实hsa_circ_0037911表达水平在两组中有显著差异。Bao等还发现hsa_circ_0037911的表达水平与血肌酐的浓度有着显著的正相关性(相关系数r=0.294,P<0.0001)。Santhanam等[35]发现血肌酐和血压有着紧密的关系,血压随着血肌酐升高而升高,血肌酐升高也是高血压的危险因素之一。结合Santhanam等关于血压和血肌酐的研究结果,推测hsa_circ_0037911可能通过血肌酐浓度影响血压[34]。Liu等[36]收集EH组(n=5)和对照组(n=5)的血液标本,高通量分析发现287个异常表达的circRNA。选取其中表达上调的hsa_circ_0126991和表达下调的hsa_circ_0041000,在另外的EH患者(n=89)和健康志愿者(n=89)中扩大验证,发现hsa_circ_0126991的表达水平显著升高,而hsa_circ_0041000的差异无统计学意义。ROC曲线分析提示hsa_circ_0126991可以作为预测EH的生物标志物,灵敏度0.724,特异度为0.673。

7 circRNA与子痫前期

子痫前期(preeclampsia, PE)是妊娠期高血压的一种,不仅影响孕妇全身多个器官,而且严重地影响胎儿的生长、发育,引起生长受限、早产甚至死亡[37]。Jiang等[38]通过高通量技术分析PE患者和健康志愿者的血样,发现2178个差异表达的circRNA,进一步验证发现hsa_circ_0001855和hsa_circ_0004904在PE患者中显著升高。酶联免疫测定怀孕相关血浆蛋白A(pregnancy-associated plasma protein A, PAPP-A),发现PE组中PAPP-A表达水平比健康志愿者显著升高[(65.78 vs 41.38) pg/mL, P<0.05]。单独应用circRNA(AUC=0.621)或PAPP-A(AUC=0.728)预测PE效能不佳;联合应用circRNA和PAPP-A建立预测模型,具有更好的预测效能(AUC=0.940)。Hu等[39]通过高通量技术分析胎盘组织,发现8553个差异表达的circRNA,其中hsa_circ_0036877在PE患者胎盘组织中的表达水平低于健康志愿者。进一步研究发现hsa_circ_0036877在PE患者外周血中的表达水平显著高于健康志愿者。hsa_circ_0036877预测PE(AUC=0.846),其灵敏度和特异度分别为85.3%和72.7%。Zhang等[40]在另外的研究中发现hsa_circ_101222联合应用血浆蛋白因子内毒素诊断PE,具有更好的预测效能,其诊断的灵敏度为70.73%,特异度为80.49%,AUC=0.876。

8 展 望

circRNA是一类特殊的双链闭合RNA,与线状RNA相比,在生物体内相对稳定[41]。一些临床研究提示circRNA在AMI后心力衰竭、PoAF、CAD、AMI、VSD、EH、PE等心血管疾病的诊断和预警中具有潜在临床应用价值。当然这些研究还存在着一些不足之处: AMI后心力衰竭研究缺乏对MICRA诊断价值的评估,患者临床基线资料不完整;PoAF研究没有对hsa_circ_025016相关信号通路进行深入研究,其调节AF的潜在机制需要探索;CAD诊断方面研究是单中心研究,易受当地环境和人文因素的影响;AMI方面研究没有扩大样本量验证circRNA的诊断作用;circRNA与VSD的研究没有证明circRNA可以直接调节心脏发育,也没有发现对mRNA或miRNA的影响;预测EH研究中临床样本量太小,且没有根据患者体质量指数进行配对。更大样本量、更多临床中心的研究才能更加令人信服地证实circRNA在心血管疾病中的诊断预警作用,同时也需要更多的基础研究以阐明circRNA在心血管疾病发生发展中的生物学作用。

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Research advances of circRNA in diagnosis and prediction of cardiovascular diseases

LÜ Meng-wei1,2, ZHANG Xing3, ZHANG Yang-yang1,2,4

(1. Shanghai East Clinical Medical College, Nangjing Medical University, Nanjing 210029, China; 2. Key Laboratory of Arrhythmias of the Ministry of Education of China, Tongji University School of Medicine, Shanghai 200120, China; 3. School of Pediatrics, Nanjing Medical University, Nanjing 211166, China; 4. Dept. of Cardiovascular Surgery, East Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai 200120, China)

【Abstract】 Circular RNA(circRNA), a kind of double-stranded closed non-coding RNA, plays essential roles in the development and progression of cardiovascular diseases. CircRNA is relatively stable with the characteristics of specific expressions and evolutionary conservation. Circ RNA has potential value in the diagnosis and early prediction of cardiovascular diseases and becomes one of the hotspots of current researches. This article reviews the current application of circRNA in clinical diagnosis and early prediction of cardiovascular diseases.

【Key words】 circular RNA; cardiovascular diseases; diagnosis; forecasting; clinical value

doi: 10.16118/j.1008-0392.2020.01.023

收稿日期: 2019-04-21

基金项目: 科技部国家重点研发计划项目(2018-YFC-1312505);江苏省“六大人才高峰”项目(2015-WSW-019);江苏省高等学校大学生创新创业训练计划(201810312058X)

作者简介: 吕梦伟(1994—),男,硕士研究生.E-mail: lmw758995787@163.com

通信作者: 张杨杨.E-mail: zhangyangyang_wy@tongji.edu.cn

【中图分类号】 R54

【文献标志码】 A

【文章编号】 1008-0392(2020)01-0130-06